Документы Государственного архива Астраханской области свидетельствуют, что посёлок Средняя Ахтуба в 18 веке образовался из трёх селений: Верхне-Ахтубинского, Средне-Ахтубинского и Заплавного. Эти селения относились к Царевскому уезду Астраханской губернии. Первыми поселенцами этих селений были бродяги, беглые ссыльные, которые прибыли на обработку шёлка на казённый шелковичный завод, построенный ещё в 1720 г. при Петре Великом, на левом берегу р. Ахтубы в 7 верстах выше села Нижне-Ахтубинского. Потом по прошествии 15 лет, сюда по распоряжению правительства в 1779 г. из внутренних губерний 1300 семейств казенных крестьян переехали для поддержания и усиления шелковичного промысла. Потом новые сходцы разъединились на три части. Одни расположились на жительство в селе Верхне-Ахтубинское, другие в Нижне-Ахтубинское, а третья часть избрали себе новое место ниже с. Нижне-Ахтубинского по течению реки Ахтубы и образовали себе новое поселение называемое Заплавное. Таким образом из вновь прибывшего числа переселенцев возникло три селения: Верхне-Ахтубинское, Нижне-Ахтубинское и Заплавное. Но так как Нижне-Ахтубинское стало занимать середину, то оно получило себе название Средняя или Средне-Ахтубинское.
Селение Верхне-Ахтубинское имело два названия — Безродное и Верхне-Ахтубинское. Безродным оно названо было от того, что его населяли люди беглые, не показывающие своего происхождения. Село основано было в 1751 г. В 1793 году было начато строительство церкви. В 1794 году оно было закончено и церковь была освящена. Церковь простояла более полувека и в 1851 году было получено разрешение от Царевского окружного правления государственного имущества построить вместо деревянной ветхой церкви каменную. Николаевская церковь в селе Верхне-Ахтубинском царевского уезда Астраханской губернии имела два предела и два престола. С одним в самой церкви во имя святителя Николая Мирликийского чудотворца, а в другом пределе во имя Покрова Пресвятой Богородицы на 350 душ обеего пола. Церковь была построена в 1866 году и освящена была в декабpe 1866 года.
Село Средне-Ахтубинское основано в 1756 г. Село отстояло от губернского города Астрахани на 400, а от уездного г. Царева на 38 верст. Граничило на севере с селом Верхне-Ахтубинским, на юге с с. Заплавным, а на востоке Уральской степью, на западе Ахтубинской долиною. Среди селения возвышалась Покровская церковь. На построение приходской церкви жители села Нижне-Ахтубинское просили разрешения в 1795 г., а закончено строительство и освящена церковь была в 1802 году. До построения церкви 20 лет существовала часовня, построенная в 1775 году. Покровская церковь была сначала построена в Византийском стиле, потом в 1899 г. была перестроена на Русско-Византийский стиль с прибавлением двух пределов с северной и южной сторон, которые предали ей вид Крестообразной.
Церковь снесли в 1933 году. Она стояла в центре поселка и выделялась на фоне других домов, храм был столь высок, что его было видно и с другой стороны реки. Пришедшие к власти коммунисты решили, что храм уж слишком заметен и разрушили её. Ломали церковь пять месяцев. Кирпичи, которые остались от православного сооружения, пошли на строительство других зданий и среднеахтубинских дорог. Очень долго не могли найти человека, который бы сбил колокол, пока наконец не согласился татарин. Как говорят местные старожилы, он потом тяжело умирал. Уверены, что сказался грех на душе иноверца.А на месте разрушенного храма установили поклонный крест
Село Заплавное основано в 1877 г. Оно заливалось разливом р. Ахтубы, по которому протекает река Подстепка, от которой селение первоначально было облито кругом водою, так как бы плавало на воде, от чего село и получило название Заплавное.
