Село Глубокое расположено в Кузнецкой котловине в бассейне реки Томи на берегу реки Глубокая. По имени этой реки село и получило своё название.
Еще в 1703 году в «Дозорной переписи Томского уезда» учтена деревня при устье реки Глубокой. В 1734 году деревня Глубокая значится в «реестре деревень от города Кузнецка вниз по Томи до Томска», составленном С. Крашенинниковым во время экспедиции.
Примерно в полутора километрах от села находится Глубокинский водопад, популярное среди туристов место отдыха. Свое начало водопад берет из расположенного чуть выше Глубокинского пруда.
Любоваться им лучше всего поздней весной или в начале лета в период «большой» воды. Тогда водопад представляет собой два полноводных рукава наполняющие небольшое озеро внизу, вода из которого убегает в лесные дебри. В другое время водопад практически пересыхает, оставляя на виду свое каменное русло, что тоже довольно живописно.
В верхней части водопада находится «джакузи», так его называют «в народе», где можно посидеть и расслабиться под потоками воды, как в гидромассажной ванне.
В расположенном выше водопада пруду водятся и ловятся карась и окунь. Берег пруда достаточно протяженный – есть множество мест для рыбалки, пикника и отдыха в палатках.