Пещера Медвежья (Заповедная) расположена на правом берегу . В этой части бассейна Лемезы развит карст. Вода постепенно размывает легкорастворимые известняки. В скалах встречаются гроты и небольшие пещеры, много суходолов и карстовых воронок.
Вход в пещеру расположен в основании невысокого скального выступа на высоте 80 м над уровнем реки Лемеза. Высокое расположение говорит о том, что карстовая полость образовалась ещё в период формирования речной долины.
Пещера невелика по протяжённости, общая длина ходов – 180 м. Пещера состоит из нескольких гротов, соединённых коридорами. Внутри довольно сыро и грязно. Обитают летучие мыши.
На сводах и стенах пещеры образовались красивые натёки. В прошлом внутреннее убранство было намного богаче. Тут были сталактиты различных видов и форм, сталагмиты, сталагнаты, гуры – кальцитовые ванночки с кристально чистой водой. Несмотря на небольшую площадь пещеры, здесь имелось большинство из известных кальцитовых форм. По богатству натёков она была уникальным памятником природы. Увы, почти всё было разрушено туристами, но даже в таком виде натёчные образования впечатляют.
Пещеру открыл в 1969 году В.А. Марушин. До этого о ней не знали даже местные жители. Попав внутрь, он обнаружил красивые натёки и… множество костей пещерного медведя. Пещера представляла собой полость, почти полностью закрытую многочисленными белоснежными сталактитами и сталагмитами. В целях сохранения внутреннего богатства вместе с коллегами Марушин решил не распространяться об открытии. Из-за этого об уникальной пещере не узнали вовремя и учёные.
Постепенно водопад Атыш привлекал всё больше туристов. Исследуя его окрестности, в конце 1970-х годов спелеологи из Уфы совершили второе открытие пещеры. О ней быстро узнали и туристы. Сюда устремились любопытствующие. Для спасения пещеры спелеологи пытались замуровать вход, но тщетно. Удивительные по красоте натёчные формы быстро разрушили, а черепа пещерных медведей растащили на сувениры или разбили.
В прошлом в пещере находилось святилище древних людей. Внутри обнаружили множество костей и черепов пещерных медведей, некоторые из которых буквально вросли в кальцитовые натёки. К сожалению, постепенно черепа растащили туристы и чёрные копатели. Некоторые из костей и черепов попали в музеи Республики Башкортостан и Челябинской области.
Согласно радиоуглеродному анализу найденных в пещере угольков, человек посещал пещеру в промежуток от 10 до 12 тысяч лет назад.
