Да, навигаторы работают в датуме WGS84, но в любом навигаторе можно менять датум ОТОБРАЖЕНИЯ координат и формат отображения координат. В меню System>Units>MapDatum>User задаете параметры пересчета координат в Pulkovo42:
DX=+21
DY=-127
DZ=-88
DA=-108
DF=+0.00480795
При этом координаты будут иметь формат градусы(минуты, секунды).
[v-dorogu.narod.ru]
Если Вы хотите иметь координаты в формате "метры генштабовской сетки", то дополнительно надо изменить формат отображения координат на User UTM и ввести
Центральный меридиан=??
Масштаб=1.0
Смещение на восток=500000.0
Смещение на север=0.0
Если Вы пользуетесь программой Ozi, то она сама переведет координаты сброшенные из навигатора (они всегда сбрасываются в WGS84) в датум своей карты.