Если программа, которую будете использовать с приемником GPS запускается и работает на ноутбуке без GPS, то и с приемником работать будет. Сам по себе процесс приема информации от приемника вполне нормально шел и на 486-х компьютерах. Ресурсов компьютера для собственно работы с приемником практически не надо...
А по-поводу "чтобы не торчало" - сложнее. Вообще говоря, антенна GPS-приемника должна "видеть" небо напрямую. С этой точки зрения металлизированный изнутри корпус ноутбука (если там такая металлизация есть) начисто отрежет прием спутников. Если расположите приемник в аккумуляторном отсеке - приемник может оказаться под материнкой, а она густо покрыта металлизацией - тоже плохо. Я видел конструкции, когда GPS располагали сразу под верхней пластмассовой панелью.
Приемник на базе SiRF-III или аналогов может конечно справиться в такой ситуации (у него большая чувствительность), но будет принимать 4-5 спутников вместо 7-8 - заметно упадет точность позиционирования.
Похоже, внешняя антенна будет очень даже не лишней!