Помогите понять:
>"GPS eTrex Legend, подгрузил векторную карту г. Томска и в итоге есть смещение трека в направлении Севера ~580 м, запада 80 м. - и это примерно постоянная величина."

Где вы наблюдаете смещение?
Если на экране GPS в режиме "on line", то у вас однозначно кривая карта. Правьте ее в GpsMapEdit.
Если на экране GPS, но трек скинут на GPS из PC, или, например, в Ozi после выгрузки трека из GPS, то надо разбираться. Как трек выгружали (загружали). Могли попутать датум при выгрузке.