Извини что длинно, короче не написать.
1. Не делай в MapMerge. В смысле даже не открывай эту прогу, т.к результат получится не очень. Где-то здесь обсуждалось почему, поищи, тема типа "вопрос к знатокам...".
2. Берем фотошоп и инсрументом Лассо обводим границу обрезки на 500м. Инвертируем выделение, закрашиваем поля чисто белым.
3. Открываем 1км и 500м в GlobalMapper. Делаем белый цвет прозрачным, Укладывем 500м поверх 1км, экспортируем в нужный формат.
4. Импортируем внутреннию привязку в OZI. т.е. получаем map файл.
ВСЁ!